2017CROPS大会在美国召开, PacBio SMRT测序推进植物基因组参考基因组序列组装成焦点
由University of Georgia、HudsonAlpha Institute for Biotechnology联合举办的2017年作物大会于6月5日～8日美国召开，会议主题是：基因组学技术及其在作物性状改良及育种项目中的应用。三天的盛会吸引了全球200多位重要作物基础研究和育种方面的专家前来参会。作为主办方之一，来自HudsonAlpha Institute for Biotechnology的Jeremy Schmutz做了会议开场报告，介绍了植物基因组学趋势、扩大转录组资源、获得新的基因组序列的植物基因组代表。Schmutz同时也就职于Joint Genome Institie(JGI)，致力于建立包含应用于食物、纤维和生物量在内的重要经济植物更高质量、更完整的参考基因组，他在报告中特别提到PacBio SMRT测序在以上这些应用中起着不同凡响的作用。Schmutz带领团队利用PacBio RSII系统已经获得了很多高质量的植物基因组序列，在PacBio 新的Sequel系统上，他们团队完成了多个棉花基因组测序和组装，以及短柄草、花生，高粱及其它作物的基因组序列。Schmutz提到，SMRT测序与其它技术最 大的不同在于它能够产生优质的基因组序列，对于后续的功能研究如基因型－表型关联分析非常有帮助。Schmutz说“我们现在已经可以获得大部分植物高质量的参考基因组序列，是PacBio将这个目标变成了现实!”Schmutz特别提到了SMRT 测序的成功之处，尤其是针对非常有挑战性的基因组，高度重复元件、富含
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